Rad unutar zatvorskog sustava je jedna od ključnih aktivnosti udruge Stijena. Kaznionice Lepoglava, Glina, a odnedavno i Turopolje redovito ugošćuju naše volontere koji kroz osmišljene radionice i osobno iskustvo motiviraju zatvorenike (prvenstveno zatvorenike s problemom ovisnosti) na trajnu promjenu životnog stila nakon odsluženja kazne. Danas svjedočimo činjenici da su nekadašnji robijaši pokazali ”drugu stranu medalje”, i dokazali da je moguća korjenita promjena temeljnih vrijednosti života. Neki od njih su se uključili u humanitarni rad u poplavljenim područjima u Gunji. Aktivnosti udruge Stijena u zatvorskom sustavu su već dugogodišnja praksa koja od prije nekoliko godina ima i financijsku potporu kroz različite projekte. Posjete kaznionici Lepoglava se odvijaju redovito svake druge srijede, a na sastancima prisustvuje oko 5-10 zatvorenika. Kaznionica u Glini ugošćuje volontere udruge svakog ponedjeljka, i tamo je odaziv na sastanke nešto veći, oko 20-30 zatvorenika. Odnedavno djelujemo i u Kaznionici Turopolje (svaki ponedjeljak), gdje je zasad prisutno 5-10 zatvorenika na sastanku. Osim toga, volonteri udruge u redovnom terminu (četvrtak) posjećuju zatvorenike u Zatvorskoj bolnici Svetošimunska, gdje ih kroz neformalno druženje i praktično služenje motiviraju na korak naprijed. Udruga Stijena teži proširivanju aktivnosti, što znači da ćemo i u zatvorskom sustavu pojačavati svoje aktivnosti sukladno našim mogućnostima koje s vremenom rastu. Suradnja s upravnim tijelima gore navedenih ustanova je izrazito dobra, a sve na korist onima koji se odluče za jedan drugačiji i bolji život.